Wskazania do leczenia homeopatycznego są szerokie. Do homeopaty najczęściej zgłaszają się pacjenci z powodu alergii, zaburzeń odporności (dzieci ciągle chorujące), rozmaitych dermatoz, w tym i łuszczycy, nerwic oraz depresji, astmy, niepłodności, impotencji, nawracającej kamicy nerkowej, dny moczanowej, chorób z autoagresji, zaburzeń metabolicznych.
Dyskwalifikuje wejście choroby w fazę nieuleczalności np. terminalne stadium choroby nowotworowej, zejściowe stadia psychoz, zaawansowane stadia niewydolności narządów.